Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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