Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ecm29Q6PDI5 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms