Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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