Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Pkp4Q68FH0 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Pkp4Q68FH0 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Pkp4Q68FH0 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Pkp4Q68FH0 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Pkp4Q68FH0 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Pkp4Q68FH0 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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