Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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PtprdQ64487 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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