Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Trim28Q62318 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Trim28Q62318 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Trim28Q62318 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trim28Q62318 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trim28Q62318 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trim28Q62318 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trim28Q62318 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trim28Q62318 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trim28Q62318 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trim28Q62318 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trim28Q62318 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trim28Q62318 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Trim28Q62318 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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Trim28Q62318 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim28Q62318 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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