Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Taf6Q62311 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Taf6Q62311 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Taf6Q62311 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Taf6Q62311 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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