Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Sall3Q62255 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Sall3Q62255 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Sall3Q62255 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Sall3Q62255 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Sall3Q62255 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Sall3Q62255 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Sall3Q62255 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Sall3Q62255 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Sall3Q62255 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sall3Q62255 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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