Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SspnQ62147 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SspnQ62147 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Gm43288-201ENSMUST00000197594 2628 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SspnQ62147 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SspnQ62147 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SspnQ62147 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SspnQ62147 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SspnQ62147 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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