Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BcanQ61361 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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BcanQ61361 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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BcanQ61361 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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BcanQ61361 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BcanQ61361 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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