Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rtl5Q5DTT4 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rtl5Q5DTT4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rtl5Q5DTT4 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtl5Q5DTT4 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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