Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gimap4-203ENSMUST00000118802 771 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm15104-201ENSMUST00000132626 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1178-201ENSMUST00000075640 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 1700019E08Rik-201ENSMUST00000134308 424 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm16618-201ENSMUST00000134992 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm17042-201ENSMUST00000167075 1216 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 1700083H02Rik-201ENSMUST00000190526 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm42733-201ENSMUST00000201272 519 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms