Protein–RNA interactions for Protein: Q3V096

Ankrd42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, mousemouse

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Length 527 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd42Q3V096 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ankrd42Q3V096 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ankrd42Q3V096 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ankrd42Q3V096 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ankrd42Q3V096 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ankrd42Q3V096 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ankrd42Q3V096 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ankrd42Q3V096 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ankrd42Q3V096 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ankrd42Q3V096 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Ankrd42Q3V096 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
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Ankrd42Q3V096 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ankrd42Q3V096 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms