Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fam35aQ3UEN2 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms