Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms