Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gse1Q3U3C9 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gse1Q3U3C9 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gse1Q3U3C9 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gse1Q3U3C9 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gse1Q3U3C9 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gse1Q3U3C9 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gse1Q3U3C9 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gse1Q3U3C9 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gse1Q3U3C9 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gse1Q3U3C9 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gse1Q3U3C9 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gse1Q3U3C9 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gse1Q3U3C9 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gse1Q3U3C9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gse1Q3U3C9 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gse1Q3U3C9 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gse1Q3U3C9 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gse1Q3U3C9 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gse1Q3U3C9 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gse1Q3U3C9 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gse1Q3U3C9 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gse1Q3U3C9 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gse1Q3U3C9 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gse1Q3U3C9 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gse1Q3U3C9 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gse1Q3U3C9 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms