Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213 ms