Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms