Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Add2-210ENSMUST00000205034 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 A430072C10Rik-201ENSMUST00000197848 2532 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Hyal1-201ENSMUST00000010195 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccbe1Q3MI99 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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