Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms