Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms