Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc21bQ0HA38 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc21bQ0HA38 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms