Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rbp2Q08652 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms