Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Siah1bQ06985 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms