Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms