Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxd1Q01822 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms