Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2bQ01097 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms