Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms