Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
SeleQ00690 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 338.3 ms