Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Trim42-201ENSMUST00000035026 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Limk2-204ENSMUST00000110029 2939 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm44541-201ENSMUST00000207837 2907 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Adamts4-202ENSMUST00000111315 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Foxp2-205ENSMUST00000115474 2544 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Slc25a13-201ENSMUST00000015256 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 M1ap-201ENSMUST00000113980 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Mapk6-201ENSMUST00000049355 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Nolc1-209ENSMUST00000225780 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Sez6l-203ENSMUST00000197425 3199 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 1700006J14Rik-203ENSMUST00000160091 2629 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Aoc1-203ENSMUST00000162948 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Prpf6-201ENSMUST00000002529 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gfpt1-201ENSMUST00000032057 2286 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms