Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SmsP97355 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SmsP97355 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SmsP97355 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SmsP97355 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SmsP97355 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SmsP97355 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SmsP97355 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms