Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Fam53b-202ENSMUST00000097998 4341 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gtpbp8-204ENSMUST00000162512 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gcm1-201ENSMUST00000024104 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Tcn2-202ENSMUST00000109988 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Stxbp5l-203ENSMUST00000114780 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Ftsj3-201ENSMUST00000021048 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Ighg3-202ENSMUST00000223179 2414 ntAPPRIS P5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Uhrf1-204ENSMUST00000113039 3391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Limk1-202ENSMUST00000111233 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Slc26a1-202ENSMUST00000119270 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 L1cam-201ENSMUST00000066576 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 D130017N08Rik-202ENSMUST00000180951 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms