Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Irx1P81068 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Irx1P81068 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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Irx1P81068 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Irx1P81068 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx1P81068 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms