Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NficP70255 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NficP70255 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NficP70255 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms