Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms