Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atp5bP56480 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms