Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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