Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NcanP55066 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NcanP55066 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NcanP55066 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Clpsl2-201ENSMUST00000025061 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NcanP55066 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NcanP55066 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NcanP55066 Saxo2-205ENSMUST00000207693 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NcanP55066 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NcanP55066 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NcanP55066 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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