Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ClgnP52194 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms