Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Tmem260-202ENSMUST00000124720 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VdrP48281 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VdrP48281 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms