Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

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Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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