Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nedd4P46935 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nedd4P46935 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms