Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms