Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc5P32043 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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