Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Scgb2b1-201ENSMUST00000189372 338 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm18492-201ENSMUST00000198141 1018 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 4931417E11Rik-201ENSMUST00000070163 1095 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Olfr1280-201ENSMUST00000082167 1003 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 1700011H14Rik-201ENSMUST00000022398 1349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Amn1-202ENSMUST00000111535 1457 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm13012-202ENSMUST00000155349 849 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa2P31245 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms