Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VtnP29788 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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