Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Cxcr1-201ENSMUST00000053389 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Ccdc65-201ENSMUST00000003444 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Uros-204ENSMUST00000106146 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gpr151-201ENSMUST00000054738 1633 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Grip1os1-201ENSMUST00000126965 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Olfr1329-201ENSMUST00000071979 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm12037-201ENSMUST00000123160 308 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm11715-201ENSMUST00000129501 695 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm7138-201ENSMUST00000167669 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 1700063D05Rik-203ENSMUST00000191461 666 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm37486-201ENSMUST00000195663 405 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm3198-201ENSMUST00000208725 1026 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 AC123698.1-201ENSMUST00000227090 402 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Tff3-201ENSMUST00000024827 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Olfr649-201ENSMUST00000060440 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm38220-201ENSMUST00000195774 1447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprmP28828 6330418K02Rik-202ENSMUST00000125662 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm12424-201ENSMUST00000179673 447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Ighv1-11-201ENSMUST00000191801 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm44159-201ENSMUST00000204065 442 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprmP28828 AC116589.8-201ENSMUST00000220945 364 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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