Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
BgnP28653 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
BgnP28653 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BgnP28653 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
BgnP28653 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BgnP28653 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
BgnP28653 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
BgnP28653 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
BgnP28653 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
BgnP28653 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
BgnP28653 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
BgnP28653 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BgnP28653 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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