Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou5f1P20263 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms