Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P20040 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P20040 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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